该研究经全自动序列测定，获得了新城疫病毒中国株Ｆ４８Ｅ９融合蛋白（Ｆ）基因１８３８ｂｐ的ｃＤＮＡ核苷酸序列，并推导出编码５４９个残基的氨基酸序列。序列分析表明，该序列中有６个潜在的糖基化位点，１３个半胱氨酸残基，裂争位点区氨基酸序列为Ａｒｇ－Ａｒｇ－Ｇｌｎ－Ａｒｇ－Ａｒｇ－Ｐｈｅ。同源性分析表明，新城疫病毒中国株Ｆ４８Ｅ９融合蛋白（Ｆ）氨基酸序列与国外发表的其他新城疫病毒株Ｆ蛋白相比，同源性在９６．１７％～９２．１６％之间。