对侵染广东省阳西县田间辣椒的黄瓜花叶病毒（cucumber mosaic wirus，CMV）的CP及2b基因进行序列分析，结果表明其CP基因与CMV亚组Ⅰ、亚组Ⅱ各株系之间的核苷酸同源率分别为90.9％～93.8％和76.1％～76．9％。氨基酸同源率分别为92．7％～97．7％和72．4％～78．1％；其2b基因与CMV亚组Ⅰ、亚组Ⅱ之间的核苷酸同源率分别为83．9％～90．2％和64．0％～67．7％，氨基酸同源率分别为79．3％～85．7％和50.5％～53.5％,由此确认该CMV分离物属于亚组Ⅰ成员．此外，CMV亚组Ⅰ成员的CP及2b基因中分别具有一段长为102bp及54bp的高度保守序列，这为转基因诱导寄主转录后基因沉默（post-transcriptional gene silencing，PTGS）CMV育种研究提供了参考．