根据GenBank已发表的猪圆环病毒2 型(PCV2) 全基因组序列,设计2 对特异性引物,对广东省不同地区规模化猪场采集的疑似断奶仔猪多系统消耗综合征(PMWS) 组织病料进行了PCV2 全基因组克隆和序列分析.结果表明,PCV2 核苷酸序列较稳定,不同地区6个PCV2 毒株全基因组序列均由1 767 bp 组成,彼此间核苷酸序列相似性达95.3%～99.8%,亲缘关系密切;与GenBank 已发表的国内不同地区PCV2 参考毒株的相似性介于70.1%～99.1%;与欧洲各地区毒株的相似性介于67.7%～98.8%;其中与美国的毒株(AY094619)差异性最大,介于69.4%～70.8%之间.