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  华南农业大学学报  2015, Vol. 36 Issue (3): 78-82  DOI: 10.7671/j.issn.1001-411X.2015.03.014

引用本文  

刘云华, 吴毅歆, 杨绍聪, 等. 洋葱伯克霍尔德溶磷菌的筛选和溶磷培养条件优化[J]. 华南农业大学学报, 2015, 36(3): 78-82.
LIU Yunhua, WU Yixin, YANG Shaocong, et al. Screening of phosphorus-solubilizing strain Burkholderia cenocepacia and optimizing of phosphate-dissolving culture condition[J]. Journal of South China Agricultural University, 2015, 36(3): 78-82.

基金项目

科技部国际科技合作项目(2009DFA32360);昆明市科技局项目(09H130301)

通信作者

何月秋(1956—), 男, 教授, 博士, E-mail: ynfh2007@163.com

作者简介

刘云华(1976—), 女, 博士研究生, E-mail: yk191232@aliyun.com

文章历史

收稿日期:2014-04-23
优先出版时间:2015-04-14
洋葱伯克霍尔德溶磷菌的筛选和溶磷培养条件优化
刘云华1 , 吴毅歆2,3 , 杨绍聪4 , 何鹏飞1 , 何月秋1,2     
1. 云南农业大学 农业生物多样性应用技术国家工程研究中心,云南 昆明 650201;
2. 云南农业大学 农学与生物技术学院,云南 昆明 650201;
3. 微生物菌种筛选与应用国家地方联合工程研究中心,云南 昆明 650217;
4. 玉溪市农业科学院,云南 玉溪 653100
摘要:【目的】 从磷矿区植物根围土中,筛选出具有较高溶磷能力的菌株及优化溶磷培养条件.【方法】 通过稀释凃板法分离、筛选菌株,并进行全细胞脂肪酸分析和16S rDNA测序鉴定; 正交试验优化溶磷培养条件.【结果和结论】 筛选出22株具有溶磷能力的菌株,其中菌株YN2014102的溶磷能力最强,在10 g·L-1的磷矿粉培养基中能释放244.75 mg·L-1水溶性磷.经全细胞脂肪酸分析和16S rDNA测序,该菌株被鉴定为洋葱伯克霍尔德菌.正交试验的结果表明,在质量浓度10 g·L-1的磷矿粉、28 ℃、摇床转速为180 r·min-1的条件下培养5 d,溶磷效果最好,达277.08 mg·L-1.
关键词溶磷细菌    磷矿粉    气相色谱分析    全细胞脂肪酸    16S rDNA    
Screening of phosphorus-solubilizing strain Burkholderia cenocepacia and optimizing of phosphate-dissolving culture condition
LIU Yunhua1 , WU Yixin2,3 , YANG Shaocong4 , HE Pengfei1 , HE Yueqiu1,2     
1. National Engineering Center for Applied Techniques of Agricultural Biodiversity, Yunnan Agricultural University, Kunming 650201, China;
2. Faculty of Agronomy and Biotechnology, Yunnan Agricultural University, Kunming 650201, China;
3. National and Local Joint Engineering Research Center for Screening and Application of Microbial Strains, Kunming 650217, China;
4. Yuxi Academy of Agricultural Sciences, Yuxi 653100, China
Abstract: 【Objective】 To isolate and screen phosphorus-solubilizing strains from the rhizospheric soil in phosphate ore zone and to optimize its phosphorus-solubilizing condition.【Method】 Dilution and plating were applied to screen and purify phosphorus-solubilizing strains. The whole-cell fatty acid was analyzed by gas chromatography and 16S rDNA sequence was identified. The orthogonal design test was used in optimizing phosphorus-solubilizing condition.【Result and conclusion】 Total 22 phosphorus-solubilizing strains were obtained by the traditional methodologies. YN2014102 strain showed a strong ability to dissolve phosphate, which could get 244.75 mg·L-1 available phosphorus from the 10 g·L-1 phosphate rock medium.YN2014102 strain was identified as Burkholderia cenocepacia based on its gas chromatography analysis of whole-cell fatty acid and 16S rDNA sequencing. When the bacterium was cultured in the 10 g·L-1 phosphate rock powder medium at 28 ℃ in a shaker with 180 r·min-1 for 5 days, the dissolve effect of solubilizing phosphorus was the best, which can obtain 277.08 mg·L-1 of available phosphorus in the medium.
Key words: phosphorus-solubilizing bacterium    phosphate rock    gas chromatography analysis    whole-cell fatty acid    16S rDNA    

磷是植物生长和生殖必需的营养元素之一,同时还能促进光合作用和碳水化合物的合成与运转,促进氮素、脂肪和核酸代谢,提高作物对环境的适应性[1].我国土壤中的总磷量相当可观,但95%以上的磷以稳定的铝硅酸盐和磷灰石等无效形式存在,难以被植物直接利用[2].磷肥在作物生长的当季利用率不到25% [3],磷肥的大量施用造成磷素在土壤中的不断积累,容易引起土壤板结以及水体富营养化等环境问题.据估算,1949—1992年间,我国累计施入农田的磷肥达3.4 × 107 t,其中大约有2.6 × 107 t磷累积在土壤中[4].因此,如何减少土壤的磷素积累,提高其利用率已成为当今的研究热点.

土壤中存在多种溶磷微生物,它们能通过自身代谢促进磷矿粉等难溶磷的溶解,使之转化为可被植物直接吸收利用的有效磷.合理利用溶磷微生物能降低磷肥的投入成本,亦可作为一项提高作物产量的重要措施[5-6].本研究以采自磷矿区植物的根围土壤为研究对象,分离、筛选出溶磷细菌,通过脂肪酸鉴定和16S rDNA部分测序鉴定出溶磷细菌的种属,研究高效菌株的溶磷效果,运用单因素筛选和正交试验[7]摸索溶磷的优化条件,为溶磷菌菌剂的开发利用提供试验依据.

1 材料与方法 1.1 样品和培养基

土壤样品采自云南玉溪磷矿区附近长势良好的玉米Zea mays、臭灵丹Laggera pterodonta,艾蒿Artemisia argyi、芒草Miscanthus、绿豆Vigna radiate等植物的根围.土样采集后贮存于透明封口袋内并编号,置于4 ℃冰箱中,保存备用.

分离筛选培养基:C6H12O6 10 g,Ca3(PO4)2 5 g,(NH4)2SO4 0.5 g,NaCl 0.2 g,MgSO4·7H2O 0.1 g,KCl 0.2 g,酵母浸膏0.5 g,MnSO4·4H2O 0.002 g,FeSO4·7H2O 0.002 g,40 g·L-1溴酚蓝(pH 6 ~ 7)6 mL,琼脂18 g,蒸馏水1 L,pH 7.0 ~ 7.2.

磷矿粉液体培养基:C6H12O6 10 g,磷矿粉10 g [w(磷)为22%],(NH4)2SO4 0.5 g,NaCl 0.2 g,MgSO4·7H2O 0.1 g,KCl 0.2 g,酵母浸膏0.5 g,MnSO4·4H2O 0.002 g,FeSO4·7H2O 0.002 g,蒸馏水1 L,pH 7.0 ~ 7.2.

1.2 溶磷菌筛选

稀释平板培养法分离、筛选溶磷菌.称取10 g土样加入盛有90 mL无菌水的250 mL锥形瓶中,28 ℃,120 r·min-115 min,制成10-1浓度溶液,然后按10倍稀释法依次制备10-2、10-3、10-4、10-5浓度土壤悬液.取10-3、10-4及10-5的土壤稀释悬液各0.1 mL均匀涂布于分离筛选培养基平板上,每个浓度重复3次.倒置平板于30 ℃培养箱中培养24 ~ 48 h,观察并测量菌落直径和溶磷圈直径,计算溶磷圈与菌落直径比.

选择溶磷圈与菌落直径比较大的菌株,接种于磷矿粉液体培养基中,30 ℃、200 r·min-1培养7 d后,测定培养液中水溶性磷含量.选择培养液中有效磷浓度最高的1个菌株开展后续的溶磷条件优化试验.

1.3 溶磷圈及水溶性磷含量测定

用灭菌的牙签将菌株分别点接在以Ca3(PO4)2为唯一磷源的培养基上,30 ℃培养5 ~ 7 d,测量溶磷圈直径(D)和菌落直径(d).

挑取单个菌落分别接入以磷矿粉为唯一磷源的液体培养基中,30 ℃、150 r· min-1培养7 d后,12 000 r·min-1、15 min,取上清液用钼蓝法测定含磷量,根据标准曲线计算出上清液中水溶性磷的含量.

1.4 溶磷细菌的鉴定

全细胞脂肪酸分析和16S rDNA测序相结合来鉴定菌株.全细胞脂肪酸分析采用Sherlock全自动细菌鉴定系统,参照说明书进行操作和鉴定.细菌DNA提取采用冻融法[8].16S rDNA基因片段的PCR扩增采用细菌通用引物P0(5'-GAG AGT TTG ATC CTG GCT CAG-3')和P6(5'- CTA CGG CTA CCT TGT TAC GA-3').PCR扩增采用20μL反应体系:10 × EasyTaq Buffer(含Mg2+)2.0μL,dNTPs(10 mmol·L-1)1.6μL,P0(10 mmol·μL-1)和P6(10 mmol·μL-1)均为1.0 μL,EasyTaq DNA Polymerase(5 U·μL-1,Transgene)0.2 μL,模板DNA(10 ~ 50 ng·μL-1)0.5 μL,补充ddH2O至20 μL.PCR反应程序为:94 ℃ 5 min,94 ℃ 1 min,55 ℃ 1 min,72 ℃ 2 min,30个循环,最后72 ℃延伸10 min.PCR产物经0.8 g·L-1的琼脂糖凝胶电泳,试剂盒回收目标条带,将回收后的16S rDNA片段连接到pMD18-T载体上,并转化大肠杆菌DH5α感受态细胞中,菌落PCR验证阳性克隆[9].确认的克隆由北京华大基因公司测序,测序结果与NCBI分子生物学数据库比对序列相似性.

1.5 正交试验

数据统计分析用软件正交设计助手ⅡⅤ3.1专业版进行处理分析.在做正交设计时,主要考虑磷矿粉量、温度、摇床转速、发酵时间对溶磷能力的影响,采用4因子3水平[L9(34)]正交试验,重复3次,试验设计见表 1.

表 1 正交试验设计 Table 1 The design of orthogonal test
1.6 数据处理

对试验中的数据采用SAS v6.12进行统计分析和Duncan's多重比较.

2 结果与分析 2.1 溶磷细菌的筛选

本次试验共筛选出22株具有较明显溶磷圈的菌株,选取溶磷圈直径(D)与菌落直径(d)比值(D/d)比较大的12株菌株,摇瓶复筛,结果见表 2.其中YN2014101和YN2014102的溶磷效果最好.菌株YN2014102在分离筛选培养基平板上,在28 ℃下培养2 d,菌落中等大小、不透明、凸起,黄色,被选作进一步研究的菌株.

表 2 溶磷细菌从磷矿石中释放出的水溶性磷含量 Table 2 Available phosphorus dissolved by the bacterial strains from phosphate rocks
2.2 菌株脂肪酸鉴定结果

以脂肪酸种类和含量为参数,与标准数据库比对,有3个菌株与新分离到的菌株YN2014102相似程度较高,其中与Burkholderia cenocepacia的相似系数最高,达0.902,与B. cenocepacia-GC subgroup B(Pseudomonas cepacia)的相似系数为0.639,与B. andropogonis的相似系数0.630.依据相似系数大小,菌株YN2014102可能属于B. cenocepacia.

2.3 16S rDNA序列分析

根据16S rDNA的测序与NCBI数据库(http://www.ncbi.nlm.nih.gov)BLAST比对的结果,与菌株YN2014102序列相似性较高的菌株均属于伯克霍尔德菌属,且与洋葱伯克霍尔德菌B. cenocepacia相似性达99%.即菌株YN2014102的16S rDNA序列比对与脂肪酸测定结果一致,故菌株暂鉴定为洋葱伯克霍尔德菌.

2.4 各因素对水溶性磷含量的影响

图 1可知,水溶性磷含量随着磷矿粉含量的增加而减少,当磷矿粉质量浓度为10 g·L-1时,可能刚好与菌体均匀悬浮,达最佳状态,所以溶磷的效果最好,故确定最佳磷矿粉质量浓度为10 g·L-1;随着时间的延长,水溶性磷含量上升后递减,所以确定最佳发酵时间为5 d;随着温度升高,水溶性磷含量先增后减,28 ℃之后增量并不是太显著,故确定最佳的发酵温度28 ℃;转速也是发酵过程中较重要的参数,改变转速会改变供氧条件,最佳转速使菌体处于最佳溶解氧状态,并使菌体处于均匀悬浮状态,由图 1可以看出水溶性磷含量随摇床转速的增加而略有增加,且180 r·min-1之后渐趋于平缓,所以最佳摇床转速为180 r·min-1.

图 1 各因素对水溶性磷含量的影响 Figure 1 Effects of different fators on the contents of available phosphorus
2.5 正交试验结果

为了优化溶磷的培养条件,根据以上单因素试验结果,设计了表 1中的4因素3水平正交试验,所得到结果如表 3.在9个处理中,A2B1C2D2的溶磷效果最好,极显著地高于其他处理,即磷矿粉质量浓度10 g·L-1,28 ℃,180 r·min-1培养5 d,菌株YN2014102在培养基中的水溶性磷达277.08 mg·L-1.以A3B3C2D1效果最差,磷矿粉10 g·L-1处理水溶性磷含量极显著地高于50 g·L-1和100 g·L-1处理的,这可能是培养基中固相物多影响了菌株YN2014102的培养。5 d后可溶性磷含量较高,这可能与培养周期长,培养基中其他营养已消耗,培养周期短,菌株YN2014102生长量不够有关.

表 3 正交试验结果 Table 3 The orthogonal test results

利用显著性差异和极差分析了各因素对水溶性磷含量的影响(表 4).从表 4可知,所选的时间,温度,磷矿粉含量,摇床转速对水溶磷的含量的影响存在显著性差异,说明这几个因素确实影响了该菌的溶磷能力.极差反映了该因素变化时对试验指标的影响,极差越大,该因素对试验的影响越显著.从总体来看,磷矿粉量的多少对培养基中YN2014102的溶磷量影响最大,其次是培养时间,温度和摇床转速.

表 4 正交试验分析1) Table 4 Range analysis of the orthogonal test results
3 讨论

具有溶磷能力的微生物有很多,目前已报道的溶磷菌主要包括芽孢杆菌属Bacillus、假单胞菌属Pseudomonas、欧文氏菌属Erwinia、土壤杆菌属Agrobacterium、沙雷氏菌属Serratia、黄杆菌属Flavobacterium、硫杆菌属Thiobacillus、色杆菌属Chromobacterium、产碱菌属Alcaligenes、节杆菌属Arthrobacter、沙门氏菌属Salmonella、肠杆菌属Enterbacter、微球菌属Micrococcus、固氮菌属Azotobacter和根瘤菌属Bradyrhizobium[10].有关洋葱伯克霍尔德氏菌溶磷、抑菌及促生长已有报道[11-15],但鲜见云南磷矿区土壤分离得到的洋葱伯克霍尔德氏菌的报道.

有关溶磷培养条件的优化也早有研究,大多从C源、N源、NaCl、pH、装液量、接种量、种龄、温度、摇床转速等方面来进行研究[16-18].溶磷过程是复杂的,并不是某一因素起全部作用,而是多种因素共同作用的结果,溶磷培养条件也会因菌株的不同而异.本试验对磷矿粉含量、培养时间、温度和摇床转速这4个因素进行洋葱伯克霍尔德菌YN2014102溶磷条件的优化,进一步证实了其具有很强的溶磷活性,明确了其溶磷活性与上述提及的4个因素紧密相关.通过正交试验,证明以磷矿粉10 g·L-1为唯一磷源,在28 ℃、180 r·min-1的条件下发酵5 d,发酵液中的水溶性磷质量浓度达到277.08 mg·L-1.然而,这种优化条件还只是试验性的,要真正运用菌株YN2014102溶磷,实现低品位磷矿石无害化应用及提高田间磷使用效率,还需深入研究.

洋葱伯克霍尔德氏菌不是一个简单种,而是一组表型相近但基因型不同的复合物,至今已发现它包括17个不同的基因型,由于这些基因型之间有很低的DNA杂交率,因此不同基因型可代表不同的种[19-21].有些种具有生物防治、促进植物生长、生物修复等功能,有些种是人类的条件致病菌,能引起肺囊性纤维化,或引起医院病人临床感染[22].因此,本研究中的菌株YN2014102究竟属于哪一个种?是否引起人类疾病,还有待下一步试验证实.

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