家蚕微孢子石和ＭＣ１两种孢子超微结构差异显著。家蚕微孢子虫孢子的外壁，质膜均只见一层结构，极膜呈封闭锥体，膜的层次清晰，极丝平均１３圈，极丝与孢子中轴倾角４１°左右；ＭＧ１微孢子的外壁有３层结构，质膜分２层，极膜层次不清，极丝平均１１圈，极丝也孢子中轴倾角４５°左右，极泡有许多大的颗粒状物。