利用正交设计L16(45)对胡枝子SRAP-PCR反应体系的5种因素(模板、Mg2+、dNTPs、引物、Taq酶)在4个水平上进行优化试验,筛选出各因素的最佳水平,建立了胡枝子SRAP-PCR反应的最佳体系(25μL):模板DNA40 ng,dNTPs 0.16 mmol/L,Mg2+1.5 mmol/L,Taq酶1.0 U,引物0.64μmol/L.采用优化的扩增体系对10种胡枝子进行了SRAP分子标记分析.筛选出的10对引物共扩增出274条带,其中244条为多态性带,占89.01%.平均每对24条.多态性条带最多的是引物组合Me21/Em1和Me6/Em9,均达到29条.10种胡枝子种间遗传距离的变异幅度为0.221～0.632.聚类分析表明以0.49为阀值,可以将10种胡枝子分为4大类.